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- Dragoncello macchiato - Callionymus maculatus
- Dragoncello minore - Callionymus risso
- Dragoncello rosa - Synchiropus phaeton
- Dragoncello turchese - Callionymus pusillus
- Dromia personata
- Drymochloa sylvatica
- Dryopteris affinis borreri
- Dryopteris dilatata
- Dryopteris filix-mas
- Drypis spinosa
- Drypta dentata
- Dryudella tricolor
- Dulcamara - Solanum dulcamara
- Duna costiera (Il Mare)
- Duna di Torrette (Il Mare)
- Dyschirius numidicus
- Dysgonia algyra e Dysgonia torrida
- Dyspanopeus sayi
- Dysphania ambrosioides
- Dysphania atriplicifolia